Trước khi chuyển hồ sơ sang Bộ Công an, Thanh tra Chính phủ đã phát hiện hàng loạt vi phạm tại gói thầu thi công dự án Bệnh viện Việt Đức cơ sở 2. Đây là dự án được Bộ Y tế phê duyệt và quyết định đầu tư (Ban Quản lý dự án y tế trọng điểm đại diện cho Bộ Y tế làm chủ đầu tư). Trải qua hơn một thập kỷ xây dựng, đến nay Bệnh viện Việt Đức chưa thể đi vào hoạt động chính thức; sai phạm của dự án đã gây thiệt hại và lãng phí hàng nghìn tỷ đồng.
Vị trí xây dựng của dự án chỉ cách đường cao tốc Cầu Giẽ-Ninh Bình 200 mét.
Một trong những vi phạm được cơ quan Thanh tra "điểm mặt" là việc trình, phê duyệt kế hoạch lựa chọn nhà thầu (bao gồm giá gói thầu) khi chưa có thiết kế kỹ thuật, thiết kế bản vẽ thi công và dự toán, dẫn đến phê duyệt giá gói thầu trái quy định.
Việc lập, phê duyệt hồ sơ mời thầu vi phạm về luật đấu thầu và xây dựng; hồ sơ mời thầu không đủ điều kiện nhưng chủ đầu tư vẫn phê duyệt để phát hành.
Các sai phạm dẫn đến nhiều hạng mục hoàn thiện nhưng không ký được phụ lục hợp đồng; không điều chỉnh được giá hợp đồng.
Dự toán thiết kế bản vẽ thi công điều chỉnh đã vượt giá gói thầu nhưng Bộ Y tế cũng không thể phê duyệt điều chỉnh được giá gói thầu do không có căn cứ pháp lý.
Việc điều chỉnh thiết kế cơ sở (phương án móng cọc) tại các gói thầu không thuộc trường hợp được thực hiện, trái quy định của luật Xây dựng, gây lãng phí, có dấu hiệu thiệt hại hơn 20 tỉ đồng.
Công trình được khởi công khi chưa đủ điều kiện để thi công (chưa có thiết kế bản vẽ thi công), vi phạm các hành vi bị nghiêm cấm tại luật Xây dựng.
Tính đến 31/12/2021, Ban Quản lý dự án Y tế trọng điểm đã thanh toán (gồm tạm ứng) nhiều tỷ đồng cho liên danh các nhà thầu và nhà thầu phụ.
Thanh tra Chính phủ xác định nhiều phần việc thuộc gói thầu bị chậm tiến độ.
Thời gian chậm ít nhất là 25 ngày, nhiều nhất là 3.233 ngày (tương đương gần 9 năm).
Theo kết luận thanh tra, trách nhiệm đối với hàng loạt vi phạm thuộc về Bộ Y tế, Bộ trưởng, Thứ trưởng phụ trách; Vụ Trang thiết bị và Công trình y tế, vụ trưởng, vụ phó phụ trách; Ban quản lý dự án y tế trọng điểm, giám đốc, phó giám đốc phụ trách; cùng các cá nhân, đơn vị có liên quan (theo từng thời kỳ).
Thanh tra Chính phủ quyết định chuyển thông tin về nội dung nêu trên đến Bộ Công an để xem xét điều tra, xử lý theo quy định.
